侯姓来源主要有：出自黄帝史官仓颉之后；以封地侯为姓；以爵号为氏，出自姬姓；春秋时郑大夫侯宜多、侯羽之后；刘氏改姓；外族改姓。
唐末，侯祚昌随王审知兄弟入闽，后迁居龙溪二十九都广览屿，即今龙海市角美镇田里社，裔孙分衍于今龙海市、芗城区、龙文区。南宋度宗时，侯宗贵迁居南安十八都怀德乡丰年里后头境，后裔播迁到晋江、深沪、安海、厦门、漳浦、龙海、平和、南靖、诏安等地。其第五子侯道经迁漳浦，开基十七都莲花峰。明、清时期，侯氏族人迁台者，以侯宗贵派下居多。侯姓在台湾以嘉义一地最旺盛。芗城区东铺头侯姓开基祖侯青山（大锣），任宣武都卫，调台湾戍卫。
台湾侯姓主要分布于嘉义县、高雄市、台北市、台南县、高雄县等地；分布较多之乡镇市区有：嘉义六脚、朴子、台南北门、高雄凤山。